Durante uno scavo presso le misteriose rovine di Clow Country, Syaoran scopre che la sua amica d'infanzia, la principessa Sakura, appare sul sito con ali che si disperdono in molte piume. Mentre la piuma scompare in dimensioni diverse, così fa la memoria di Sakura. Nel tentativo di salvare la vita di Sakura e ripristinare la sua memoria, Syaoran viaggia in un altro mondo per trovare una soluzione. C'è solo una cosa che gli resta da fare. Viaggia in diverse dimensioni per raccogliere le piume di Sakura. Ad aiutare nella ricerca c'è Kurogane, un ninja esiliato dal Giappone che desidera tornare nel suo mondo, il mago in fuga, Fay, che desidera saltare tra ogni mondo per non tornare mai più al suo e la creatura a forma di panino bianco, Mokona.