Un giorno Amu incontra a scuola una studentessa super vivace della scuola elementare Seiyo Academy di nome Hiiragi Rikka. Non solo può vedere i personaggi guardiani, ma sembra che abbia anche altri poteri misteriosi. Quando vede il lavoro che Amu e gli altri Guardiani fanno a scuola, rimane sbalordita. Ogni episodio di 24-25 minuti è composto da una serie di cortometraggi in stile spettacolo di varietà (tra cui Shugo Chara! Pucchi Puchi) della durata totale di circa 9-10 minuti, seguito dall'animazione principale di 11-12 minuti intitolata Shugo Chara!! Dokki Doki, che è l'effettiva continuazione della stagione 2 e viene fornita con la sua animazione di apertura. Il tempo rimanente è occupato dal riempimento live action tra ogni sezione e completato con i temi di apertura/fine all'inizio e alla fine dell'episodio.