In una fiaba che prende vita, il goffo, dolce e gentile Ahiru (giapponese per "anatra") sembra un protagonista improbabile. In realtà, Ahiru è magica quanto i gatti parlanti e i coccodrilli che abitano la sua città, perché Ahiru è davvero un'anatra! Trasformata dal misterioso Drosselmeyer in una ragazza umana, Ahiru scopre presto il motivo della sua esistenza. Usando il suo magico ciondolo a forma di uovo, Ahiru può trasformarsi nella principessa Tutu, una bellissima e talentuosa ballerina le cui danze sollevano le persone dal tumulto nei loro cuori. Con la sua nuova abilità, Ahiru accetta la sfida di raccogliere i frammenti perduti del cuore del suo principe, perché molto tempo prima lo aveva frantumato per sigillare un corvo malvagio per l'eternità. Princess Tutu è una storia di eroi e della loro lotta contro il destino. Le loro convinzioni, i loro sentimenti e, in ultima analisi, le loro azioni determineranno se questa favola riuscirà a raggiungere il suo "per sempre felici e contenti". La principessa Tutu è andata in onda in due parti. La prima parte comprendeva 13 episodi di 25 minuti, mentre la seconda parte consisteva in 24 episodi di 12 minuti con un episodio finale di 25 minuti per un totale di 38 episodi.