La storia è ambientata nel Paese dei Diamanti Minerari, di cui Diancie è la principessa. Questo è un paese situato nelle profondità del sottosuolo, dove i Pokémon Carbink vivono insieme in pace. La fonte di energia di questo paese è un diamante gigante chiamato Diamante Sacro, che può essere creato solo dalla principessa Diancie. Tuttavia, l'attuale principessa non possiede ancora il potere di creare un tale diamante, e il potere dell'attuale Diamante Sacro si esaurirà presto, il che comporterebbe la fine del paese. Diancie incontra Ash e Pikachu e parte insieme a loro alla ricerca del leggendario Pokémon Xerneas, che possiede un potere sacro, ma lungo la strada trovano il bozzolo dove il Pokémon Distruzione, Yveltal, che si dice abbia distrutto la vita a Kalos, è in agguato.