La storia si svolge in un mondo in cui un virus sconosciuto ha ucciso l'intera popolazione umana ad eccezione dei bambini sotto i 13 anni. Quei bambini sono stati poi ridotti in schiavitù dai vampiri. Il manga è incentrato su Yuichiro Hyakuya, un umano che sogna di diventare abbastanza forte da uccidere tutti i vampiri.