La seconda stagione di NieR:Automata Ver1.1a. Anno 11954. I soldati YoRHa 2B e 9S sono stati recentemente inviati sulla Terra per svolgere e supportare la 243a Operazione di Discesa. Lì, riescono a distruggere le unità centrali della forma di vita della macchina, Adamo ed Eva. Con l'annientamento di questi nemici, l'Esercito dell'Umanità coglie l'occasione per porre fine a questa lunga guerra e decide un attacco a tutto campo contro le forme di vita delle macchine. Questa è una testimonianza delle battaglie e delle speranze degli androidi e del destino che li detta tutti... Mentre la guerra infuria, l'Unità 2B e altre come lei mettono in discussione il loro ruolo. Reclamare il pianeta richiederà sacrifici, ma quanto di più possono dare e l'umanità vale il costo?