Continuando da dove si era interrotta la prima stagione, l'improvviso aumento di Thanatos con la scomparsa dei Cacciatori dell'Aube ha ormai lasciato Arcadia in rovina. La disperazione regna alta mentre l'Organizzazione Religiosa combatte per combattere i Thanatos. Erano già passati sei mesi da quando la villa di Hidamari era stata ridotta in cenere, i Cacciatori dell'Aube, un tempo acclamati come eroi, sono ora incolpati per l'apparizione di Thanatos. Tuttavia, esiste ancora la speranza per la ricomparsa un giorno dell'Uovo della Regina, che diventerà il salvatore di Arcadia. All'insaputa di molti, tuttavia, i Cacciatori di Aube hanno in realtà aspettato in silenzio il risveglio di Angelique, che ha dormito per tutto il tempo.