I ninja con limiti di sangue iniziano a scomparire in tutti i paesi e la colpa è rivolta alla nazione del fuoco. Per ordine di Tsunade, Kakashi viene sacrificato per impedire una guerra totale. Dopo aver ereditato gli incantesimi lasciati da Kakashi, Naruto combatte tra amici e nemici per prevenire la sua morte mentre cambia le menti di coloro che hanno ereditato la volontà del fuoco.