U.C. 0097. L'anno in cui è stata aperta la Scatola di Laplace. Nonostante la rivelazione della carta originale per il Secolo Universale, che riconosce l'esistenza dei Newtype e i loro diritti, il mondo rimane in gran parte immutato. Dopo la distruzione della forza residua di Neo Zeon nota come le Maniche, l'evento che è diventato noto come "l'Incidente di Laplace" sembra essere giunto al termine. Nella battaglia finale, due mobile suit Full Psycho Frame hanno mostrato un potere che va oltre l'immaginazione umana. La minaccia dell'Unicorno Bianco e del Leone Nero è stata sigillata lontano dalla coscienza pubblica, ed è stata consegnata per essere dimenticata dalla storia. Ma ora si stanno segnalando avvistamenti della RX-0 Unicorn 03, a lungo creduta persa due anni fa. Il suo nome è Phenex, un uccello d'oro immortale.