Nella grande città di Metropolis, severe strutture comunitarie e pregiudizi dominano un mondo in cui umani e robot vivono insieme. I disordini e la violenza aumentano ogni nuovo giorno. Alla ricerca dello scienziato Dr. Laughton, sospettato di violare i diritti umani commerciando organi, il detective giapponese Shunsaku Ban e suo nipote Kenichi arrivano a Metropolis. Nel laboratorio dello scienziato, Kenichi scopre una ragazza senza alcun ricordo della sua vita passata. Decide di aiutarla, così scappano insieme. Suo zio lo segue e penetra negli oscuri segreti della città per trovare il Duca Rosso, l'uomo che governa dall'ombra. Nel frattempo, Kenichi cerca disperatamente di proteggere la misteriosa ragazza dalle persone che le danno la caccia. Tuttavia, Duke Red e il suo figlio adottivo hanno le loro profonde ragioni per inseguire la ragazza. Queste ragioni sono legate alla sua vera identità e alla lotta per il dominio di Metropolis...