Takamachi Nanoha, un bambino di terza elementare, si è imbattuto in un furetto parlante ferito dopo aver sentito le sue grida telepatiche di aiuto. Il furetto si rivelò essere Yuuno, un archeologo e mago di un altro mondo che aveva accidentalmente sparso i pericolosi Semi Gioiello in tutta la Terra. Senza la forza di raccogliere i Semi Gioiello, Yuuno aveva ripreso la forma di furetto e aveva bisogno di qualcun altro che si occupasse del compito per lui. Diede un gioiello rosso a Nanoha, spiegandole che con questo poteva trasformarsi e usare la magia per combattere i mostri che li minacciavano a causa dei Jewel Seeds. Ma i mostri sono l'ultima delle loro preoccupazioni, poiché Yuuno e Nanoha non sono gli unici a raccogliere i Jewel Seeds.