Dieci anni dopo aver affrontato la sconfitta nella Quarta Guerra del Santo Graal, Waver Velvet, ora Lord El Melloi II, insegna alla Torre dell'Orologio, il centro di formazione per i maghi. Tuttavia, il suo nuovo status di "Signore" comporta un avvertimento: obbedire agli ordini di Reines, la sorella minore del defunto Kayneth El Melloi, fino a quando non sarà abbastanza grande da governare la Casa di El Melloi. Waver, insieme al suo misterioso apprendista Gray, si occupa di una serie di casi assegnati da Reines e dall'Associazione dei Maghi. Con ogni caso che si rivela più complesso del precedente, potrebbe esserci di più nella Torre dell'Orologio di quanto sembri, e quali segreti nasconde Reines?