La nuova ragazza nella vita di Riki Naoe ha bisogno del suo aiuto o sta davvero cercando di ucciderlo? Dopo che un incontro casuale su un tetto porta l'enigmatica Saya Tokido nel mondo dei Little Busters, l'unica cosa certa è che i guai seguiranno sicuramente. Riki ora deve anche districare una rete di nuovi misteri che sembrano essere radicati nel suo passato personale! Chi sono i Dirigenti Oscuri, perché vogliono tenere separati Saya e Riki e qual è la natura del tesoro segreto che Saya cerca? A volte, le risposte portano a ancora più domande in LITTLE BUSTERS! EX!