La storia è ambientata due anni dopo la storia di Gundam Build Divers, con una nuova versione del gioco "Gunpla Battle Nexus Online" (GBN), e nuovi Divers: Hiroto, un subacqueo solitario che gioca come un mercenario; Kazami, un vagabondo che passa da una festa all'altra; May, una misteriosa subacquea solitaria che partecipa tutto il giorno ai Gunpla Battles; e Parviz, un subacqueo principiante che ha un atteggiamento introverso ma desidera il gioco cooperativo. Mentre tutti e quattro vivono esistenze solitarie, sono riuniti dalle circostanze per formare una squadra in un'esperienza che va oltre GBN.