La visual novel Grisaia no Meikyuu è una raccolta di sequel per tutte le eroine del gioco e include anche una storia prequel per l'eroe e dozzine di racconti. Il primo episodio sarà uno speciale di 60 minuti che andrà in onda alla fine di marzo. Dopo aver frequentato l'Accademia Mihama per circa un anno, Yuuji Kazami sembra aver trovato il suo posto all'interno della scuola, ma improvvisamente decide di perseguire una promozione nel CIRS. Dopo aver consultato JB sulle sue intenzioni, entrambi esaminano a fondo i documenti di Yuuji e analizzano gli eventi della sua educazione per determinare se il lavoro è adatto a lui. Nel frattempo, all'insaputa delle due, le ragazze di Mihama scoprono alcuni documenti strappati nella stanza di Yuuji. Dopo aver restaurato le carte, scoprono la storia che ha formato, o forse spezzato, Yuuji nell'uomo che è oggi. Tuttavia, quella che si pensava essere la storia lo ha perseguitato fino al presente, e le catene del passato iniziano a trascinarlo di nuovo nell'oscurità...