Un alchimista fuggitivo dalle misteriose abilità conduce i fratelli Elric in una lontana valle di baraccopoli abitata dai Milos, un popolo orgoglioso che lotta contro lo sfruttamento burocratico. Ed e Al si ritrovano rapidamente nel bel mezzo di una ribellione in ascesa, mentre i Milos in esilio si scagliano contro i loro oppressori. Al centro del conflitto c'è Julia, una giovane alchimista amica di Alphonse. Non si fermerà davanti a nulla per riportare i Milos al loro antico splendore, anche se ciò significa sfruttare il terribile potere della mitica Pietra Filosofale.