Il primo film di una trilogia che trafigge il terzo percorso della popolare visual novel: Fate/stay night. 10 anni dopo la Guerra del Santo Graal, una battaglia condotta da Padroni e Servitori per il contenitore che esaudisce i desideri, il Santo Graal, scoppia un'altra guerra nella città di Fuyuki. Shirou Emiya, il figlio adottivo di Kiritsugu Emiya, un partecipante alla precedente Guerra del Santo Graal, sta conducendo una vita pacifica con le persone a lui care. Particolarmente vicino a lui è la sua studentessa Sakura Matou, che porta gentilezza nella sua vita altrimenti solitaria. Ma una volta iniziata la Guerra del Santo Graal, la vita pacifica di Shirou viene spezzata.