Cresciuto da un misterioso stregone dopo la morte dei suoi genitori in un catastrofico incendio, Shirou Emiya ha appena iniziato a imparare piccoli bocconcini di magia. Quando viene coinvolto in una battaglia tra due potenti Magi, tuttavia, finisce per eseguire un incantesimo al di sopra delle sue capacità previste, evocando accidentalmente una bellissima cavaliere donna per proteggerlo. Shirou viene quindi involontariamente catapultato nella competizione nota come la Guerra del Santo Graal, in cui i Sette Magi chiamati Maestri, insieme ai loro partner spirituali chiamati Servitori, combattono per acquisire un potente artefatto che si dice esaudisca ogni desiderio.