Mentre l'equipaggio di Cowboy Bebop viaggia tra le stelle, viene a conoscenza della taglia più grande di sempre, ben 300 milioni di Woolong. A quanto pare, qualcuno sta brandendo un'arma chimica estremamente potente, e naturalmente le autorità non riescono a fermarla. La guerra per abbattere il criminale più pericoloso costringe l'equipaggio ad affrontare un vero pazzo, con la minima speranza di riuscirci.