La storia è ambientata nella foresta di Okoya, un paradiso pokémonico protetto da rigide regole che vietano agli estranei di mettervi piede. Il film è incentrato su Coco, un ragazzo che è stato cresciuto dai Pokémon e si considera anche lui tale, trattando il Pokémon misterioso Zarude come suo padre. Ash e Pikachu incontrano Coco durante un'avventura. Il film si concentra sul tema di un "umano cresciuto dai Pokémon", invece del "legame tra un allenatore umano e i suoi Pokémon".