Aprile 2095. È passato un secolo da quando la magia si è affermata come tecnologia vera e propria. I due fratelli si iscrivono a una prestigiosa scuola per maghi chiamata National Magic University Affiliated First High School, meglio conosciuta come "Magic High School". Tatsuya, il fratello maggiore, è un "irregolare" con un difetto fatale nei suoi poteri magici. La sorella minore, Miyuki, è una studentessa stellare con un talento magico senza pari. Anche se ora sono abbastanza vicini da essere scambiati per coppia, solo pochi anni fa i due avevano una relazione disfunzionale, in cui non erano altro che un padrone e un servo. Un incidente, tuttavia, altera per sempre la loro relazione. Tre anni fa a Okinawa, un'esperienza indimenticabile capovolge le loro anime e i loro destini.