La storia inizia con una minaccia contro il governatore di Tokyo, ma la prontezza di pensiero di Conan impedisce qualsiasi incidente mortale quando un tunnel della metropolitana viene fatto saltare in aria. Conan scopre che potrebbe esserci un collegamento con un villaggio che è stato trasferito per la costruzione di una diga, e corre per fermare il criminale prima del prossimo attacco.