Decenni fa, un essere noto come il Gigante della Luce si unì a Shin Hayata del Gruppo di Ricerca Speciale Scientifica per salvare la Terra da un'invasione di mostri terrificanti noti come Kaiju. Ora, molti anni dopo, quei giorni bui stanno svanendo nella memoria e il mondo è in pace. Ma nell'ombra sta crescendo una nuova minaccia, un pericolo che può essere affrontato solo da un nuovo tipo di eroe: un nuovo tipo di Ultraman... Shinjirou è un adolescente normale, ma suo padre è il leggendario Shin Hayata. Quando scopre che suo padre gli ha trasmesso il "Fattore Ultraman" e che possiede poteri incredibili, nulla sarà più lo stesso.