Il dio minore Yato è sfortunato. Stufo del suo stile di vita da fannullone, la sua compagna lo abbandona bruscamente. Non ha soldi, non ha fedeli e non ha un santuario da chiamare casa. Ma proprio quando le cose iniziano a sembrare senza speranza, un incidente d'autobus lo costringe a incrociare la strada di Hiyori Iki, una liceale dolce e vivace. Dopo l'incidente, l'anima di Hiyori ha la cattiva abitudine di scivolare fuori dal suo corpo e, dopo aver chiesto l'aiuto di Yato per riportarla alla normalità, inizia a cadere nel mondo degli spiriti e degli dei. Ma Hiyori non è l'unica a tenere d'occhio Yato. Un dio del passato di Yato è tornato e non è interessato a una riunione amichevole.