A Tokyo si apre una misteriosa voragine nel quartiere di Machida, seguita da una brutale strage in cui quasi tutti gli abitanti vengono assassinati. L’unico indizio è una reliquia medievale, la Durj Box, e un enigmatico vecchio. Cinque anni dopo, Tokyo è divisa tra modernità e degrado criminale. Ranmaru Shindo, uno dei pochi sopravvissuti, diventa poliziotto per svelare il mistero. Durante un'indagine, affronta mostri inspiegabili e viene salvato dalla TOKKO, una squadra speciale della polizia. Qui incontra Sakura Rokujo, legata ai suoi ricordi della tragedia.